Illyasviel von Einzbern, surnommée Illya, a accompli la mission que lui avait confiée Rin Tôsaka : récupérer les Class Cards. Peu après, elle apprend tant bien que mal à faire la connaissance de Chloé, une fille qui lui ressemble étrangement ; mais toutes les épreuves passées paraissent être une partie de plaisir à côté de l'assaut de Bazett Fraga McRemitz, qui vient de raser le manoir des Edelfelt….