Kobato est une petite fille très maladroite et très attachante, qui vient sur terre dans le but de soigner les cœurs blessés. Plus elle soignera de cœurs, plus la petite bouteille qu'elle possède se remplira. Elle est toujours accompagnée d'un chien bleu, Ioryogi-san, qui prend souvent un aspect effrayant et qui, à l'instar de Keroberos dans "Sakura", cherche à se faire passer pour une peluche aux yeux des autres..