Shinjuku, une tueuse à gage du nom de code Glass Heart est rongée par les remords des meurtres qu'elle a commis et se suicide en se jetant du haut d'un immeuble. Ses employeurs font tout pour la maintenir en vie, et volent le cœur d'une femme décédée au même moment, celui de Kaori, la femme du célèbre Ryo Saeba morte le jour de leur mariage….