L'histoire nous entraîne aux côtés de Jintan, Anaru, Yukiatsu, Tsuruko, Poppo et Menma, 3 jeunes filles et 3 jeunes garçons inséparables vivant à la campagne. Malheureusement, après un accident mortel qui est arrivé à Menma, le groupe d'amis se sépare. Suite à ces éventements, chacun ont choisi un chemin différent : Anaru passe la plupart de son temps avec ses amies, Poppo rêve de voyage, Yukiatsu et Tsuruko sont dans le même lycée et restent toujours ensemble et Jintan est devenu un Hikikomori. Un jour, l'esprit de Menma revient chez Jintan en été sans aucune explication et lui demande de réaliser son souhait....