Shinobu est une ninja naïve en formation. Afin de tester ses capacités de ninja, elle doit voler les culottes de toutes les lycéennes. La première maison où elle s'arrête est celle de Kaede Shiranui, qui surprend Shinobu en flagrant délit. Kaeda est la voix de la raison et les deux filles deviennent rapidement amies, malgré une balle ronde jaune qui prétend être un maître ninja et qui tente d'entraver leur amitié..