Les vacances d'été sont à présent terminées. Ben, Gwen et leur grand-père Max peuvent enfin souffler. Ils laissent derrière eux leurs aventures pour revenir à une vie de tous les jours, partagée entre la famille, les amis et l'école. Mais de retour à la maison, les choses ne n'annoncent pas exactement comme prévu. Eon, le premier extraterrestre capturé par l'oganisation secrète de Max, est de retour. Il revendique l'Omnitrix pour provoquer le début d'un e invasion d'aliens qui entraînerait la fin de l'humanité... Titre original : Ben 10: Race Against Time TV